县里的农合（农村合作医疗）是可以在市级医院使用的。但是，需要注意，在市级医院使用农合时，可能不能直接在医院进行报销。需要在住院后三日内，携带医院的确诊证明到农合备案，并在出院后的10个工作日内，准备好身份证、医疗证、户口本、备案登记表、医院盖章的缴费费用明细、住院收费单、病例复印件等相关材料，回到老家当地的农合部门进行报销。此外，农合在市级医院的报销比例通常会低于在县级及以下医院的报销比例。

请注意，具体的报销流程和报销比例可能因地区和政策的不同而有所差异。因此，在使用农合前，建议详细咨询当地农合管理部门或医院，了解具体的报销要求和流程，确保能够顺利使用并享受农合的报销政策。