是的，抖店保证金在申请退店时需要等待订单完成才能退还。根据抖音小店的退款流程，商家在申请关店前需要确保店铺内没有未完结或未售后的订单，以及没有未偿还的欠款。只有在这些条件满足的情况下，商家才能申请退店并退还保证金。

具体操作步骤如下：

1. 点击【店铺】-【退店】，选择【申请关店】。

2. 填写退店联系人信息。

3. 售后处理：当有订单状态未完结时，系统会提示您有未完结的订单，需要先将售后订单处理完毕。最晚一笔订单完成之后 3 个月才能进行下一步。

一旦订单全部完成且符合退款条件，商家可以向平台申请退还保证金。一般情况下，退款申请审核通过后，保证金会在 20 个工作日内退还到商家的账户。请注意，退款具体到账时间可能因银行及平台处理速度而有所不同。

总之，抖店保证金的退还确实需要等待订单完成。在申请退店前，请确保店铺内所有订单均已处理完毕，以满足退款条件。