参考文献格式不正确可能涉及到空格过大、对齐不准确等问题。以下是一些处理参考文献格式不正确的方法：

1. 检查文献引用格式：首先要确认所使用的参考文献引用格式是否符合学术要求，例如APA、MLA等。确保按照规范来引用文献。

2. 使用文献管理工具：借助文献管理工具如EndNote、Zotero等进行文献引用和参考文献格式的管理，可以提高准确性和效率。

3. 调整段落格式：参考文献中的空格过大或对齐不准确，可以通过调整段落格式来解决。在Word等文本编辑软件中，选择相应的参考文献段落，点击段落格式设置，调整行距、间距和缩进等属性，使得文献对齐合理。

4. 校对文献信息：检查每个参考文献的作者、题目、出版日期等信息是否准确完整。确保所有文献信息都符合引用格式要求。

5. 参考其他样例或指南：参考相关样例或指南，比如学校提供的论文格式指南、出版机构的参考文献样例等，以获取正确的参考文献格式。

6. 寻求帮助：如果遇到困难，可以咨询导师、同学或图书馆的学术写作支持人员，寻求他们的帮助和指导。

总之，处理参考文献格式不正确的关键是严格按照引用规范操作，合理调整段落格式，并仔细核对文献信息。