在理论上，使用5.2的螺纹钻头钻M6的底孔是可以的，因为直径略小的5.2的螺纹钻头可以在M6的孔上起到类似于镶嵌的效果，既可以保持螺纹的稳定，又可以避免孔口过大。但是需要注意的是，如果使用过小的钻头，会使得螺纹的质量变差，预留出的M6钻孔反而不能完全发挥作用，从而影响整个产品的稳定性和安全性。因此在实际应用中，应该根据具体情况选择合适的钻头，以确保产品的质量和稳定性。