想清理鱼缸底沙中的粪便，首先需加强缸内的过滤系统，还可在换水时用管子将底部的污物吸出来。建议每隔一段时间就清理一次，以保证水质的稳定。

也可在缸内养殖一些工具虾和工具鱼来清理，它们会将粪便吃掉，不过只能短期有效，因为这些生物也会排泄，时间长了也会污染水质。

饲养者可降低鱼缸的饲养密度，从而减少粪便。还可减少喂食量来减少底沙中的粪便，喂食量增加容易导致残饵和粪便的增加，从而会对水体造成污染。