如果农村自建房只有地契没有房产证，可以先去当地房管所咨询相关手续，提交申请并缴纳相关费用进行房产证的办理。

如果是个体营业执照，则需要向县级以上税务机关申请个人所得税完税证明，并提交相关材料如产权证明、身份证等，再按要求缴纳个人所得税，最后办理房产证。