要去南碇岛，首先需要前往福建省厦门市。从厦门高崎国际机场出发，乘坐机场大巴到厦门火车站，然后乘坐K1221/K1222班高崎-福州南次快速列车到福州南站。

在福州南站乘坐公交车或出租车前往福州岛内码头，然后搭乘岛外汽车前往佳美海洋公园码头，再搭乘船只到达南碇岛。船票价格为40元左右，船程约30分钟。需要提前查询船班时间和票价，注意安排好行程。