计算方法一般有以下两种：

1. 原价全额赔付。即超市需要根据过期食品的原价，赔付消费者商品的全部价格，消费者可以选择退货或者选择以同等价格购买其他商品。

2. 按照折旧价格赔付。超市可以根据过期食品的原价和保质期，计算出商品的使用时间，按照商品使用时间的折旧程度进行赔付，赔付金额为过期食品原价减去商品使用时间折旧价格的金额。

通常情况下，超市经营过期食品应该进行回收处理，不应该出售给消费者。同时，超市需要及时更新改善自身的管理体系，负责任地对消费者进行说明，对超市自身进行监管和管理，从源头上避免过期食品的出现。