据我了解食品合规管理证书主要关注食品生产和销售过程中的法律法规和标准要求，确保企业遵循相关规定。而粮农食品安全评价证书则更侧重于评估食品的安全性和质量，包括营养成分、微生物、农药残留等方面。总的来说，前者关注合规性，后者关注产品质量和安全性。