要申请跨省异地特殊门诊，首先需要准备相关材料，包括就诊医院的诊断证明、病历资料、住院证明等。

然后，将这些材料提交给所在省的医保部门，填写申请表格并提供个人身份证明。

医保部门会审核申请材料，并将其转交给目标省的医保部门。目标省的医保部门会进一步审核申请，如果符合条件，会发放特殊门诊就医凭证。凭借该凭证，可以在目标省的指定医院进行特殊门诊就诊。申请流程可能会因地区而异，具体操作可咨询当地医保部门。