保证金纠纷属于建工合同。

建设工程合同也称建设工程承发包合同，是指由承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。按照《中华人民共和国合同法》的规定，建设工程合同包括三种，即建设工程勘察合同、建设工程设计合同、建设工程施工合同。而保证金合同属于保证合同纠纷案由，是建设工程合同中的一种。