热水器开关有水垢可以通过以下几种方法进行处理：

1. 使用醋酸：将一定量的醋酸浸泡在布或棉球上，然后将它们覆盖在有水垢的开关上。让醋酸在开关上停留一段时间，然后用清水擦拭干净即可。

2. 使用柠檬汁：将柠檬汁涂抹在开关上，让其停留片刻，然后用清水擦拭干净。柠檬汁中的酸性物质可以溶解水垢。

3. 使用酸性清洁剂：市场上有一些专门用于清除水垢的酸性清洁剂，可以按照说明使用，注意保护好自己的手部和眼睛。

4. 使用刷子或牙刷：用刷子或牙刷轻轻刷洗开关上的水垢，可以借助一些清洁剂或温和的洗涤剂。

无论使用哪种方法，务必确保断电并拆下相关部件进行清洁，确保安全。另外，定期清洁热水器开关可有效减少水垢的积聚。