密西西比州首府杰克逊(Jackson)是全州最大城市，其他重要城市包括比洛克希(Biloxi)、默里迪恩(Meridian)、哈蒂斯堡(Hattiesburg)、格林维尔(Greenville)、格尔夫波特(Gulfport)、维克斯堡(Vicksburg)等。

全州地势低洼，最高点在东北部丘陵地带的伍达尔山，海拔仅246米。西北部为亚祖河与密西西比河冲积而成的新月形肥沃地带，称为"三角洲"。