曲阜的行政区划演变史如下:
商朝时,曲阜为奄国都;周朝时,周武王将其胞弟、王国辅臣周公旦封到少昊之墟曲阜,国号鲁;秦朝时,曲阜并为薛郡治,郡治设在曲阜;西汉时,曲阜为鲁县,是徐州鲁国国治;东汉时,曲阜为鲁国,是豫州鲁国国治,后为东海国国治;魏、晋时,曲阜为鲁县,是豫州鲁郡郡治;南北朝时,曲阜为鲁县,属兖州鲁郡;隋朝时,隋开皇十六年(596),初定名为曲阜,先属兖州,后改属鲁郡;唐朝时,唐贞观元年(627)入泗入县,八年复置,属兖州;北宋时,北宋大中祥符五年(1012)改为仙源县,徙治大鲁城东北八里(今旧县村)属京东东路袭庆府;金朝时,金天会七年(1129)复名曲阜县,属兖州;元朝时,曲阜属山东东西道济宁路总管府兖州;明朝时,明嘉靖三年(1524)还治古鲁城,属兖州府;清朝时,曲阜属山东省兖州府;民国时期,1914年属济宁道;中华人民共和国成立后,1986年6月,经国务院批准,撤销曲阜县,设立曲阜市。