对于超过新农合缴费截止时间的情况，以下是一些可能的处理方式：

补缴保费：在缴费年度的1至9月期间，错过集中缴费期的人群还可以补缴当年度保费。自补费满2个月后的次月1日起，即可开始享受城乡居民医保待遇。

补缴并缴纳罚款：如果错过缴费时间，需要补缴保险费和滞纳金。滞纳金的计算方式是：每月应缴社会保险费×欠缴天数×万分之五。

申请延期缴费：部分地区可能允许因特殊原因错过缴费时间的人群申请延期缴费。但需要注意的是，延期缴费可能会影响医保待遇的享受时间。

需要注意的是，不同地区的具体规定可能会有所不同，因此建议在错过缴费时间后，及时咨询当地社保部门或相关部门，了解具体的处理方式。