有以下两种可能的原因：

1.有一只脚受伤了，导致受伤的那只脚在跑步时会有疼痛感

2.有一只鞋子坏了，导致穿坏鞋的那只脚在跑步时出现硌脚、磨破皮等脚痛的情况