三层鱼缸架的合理摆放方式主要取决于你的观赏角度和需求。以下是一些建议：

高度排列：一般来说，从上到下，每一层都可以放置不同种类的鱼缸，比如上层可以放置小型热带鱼缸，中层可以放置大型淡水鱼缸，下层可以放置大型海水鱼缸。这样可以更好地满足不同高度的观赏需求。

主题排列：每一层鱼缸可以放置不同主题的鱼缸，比如上层放置热带鱼缸，中层放置金鱼缸，下层放置鲨鱼缸。这样可以展示不同种类的观赏鱼，增加视觉效果。

大小排列：从上到下，每一层鱼缸可以按照大小排列，从最小的鱼缸到最大的鱼缸。这样可以形成一种层次感，让整个鱼缸架看起来更加协调。

颜色排列：每一层鱼缸可以按照颜色排列，比如上层是红色的热带鱼缸，中层是蓝色的金鱼缸，下层是绿色的鲨鱼缸。这样可以增加视觉冲击力，让整个鱼缸架更加生动。

总之，三层鱼缸架的合理摆放方式需要根据实际情况来选择，最重要的是要满足自己的观赏需求，并且要让整个鱼缸架看起来协调、美观。