市场准入负面清单由国务院发展研究中心牵头制定，由国家发改委、商务部等相关部门参与制定，并在国务院的领导下执行。

这是因为负面清单是国家对外开放政策的重要组成部分，涉及到外商投资和市场准入等方面的内容，需要国家有关部门协同配合，才能够更好地促进我国经济发展。

此外，负面清单制定也需要考虑到各行业、各领域的具体情况，各相关部门具有专业的知识和经验，能够更好地综合各方面因素，制定出更为科学合理的负面清单。