甲企业以房产投资乙企业不一定需要缴纳税款。

因为涉及到税收的因素比较复杂，需要具体分析甲企业所持有的房产是否已经进行了出租、出售等交易行为，如果出租或出售所得的收益直接归甲企业所有，则甲企业需要缴纳相应的房地产税或所得税；但如果甲企业通过其他方式与乙企业合作进行项目合作或股权投资等，且没有直接参与乙企业的经营管理，则甲企业不需要缴纳税款。

需要注意的是，上述的结论仅供参考，具体情况需要根据法规、政策及相关文件来判断。