在电影《无间道2》的结局中，倪永仁的命运是悲剧性的。

倪永仁在电影中被韩琛射杀，临死前发现一直信任的弟弟倪永仁实际上是警方卧底。这个发现让他非常痛苦。在电影的高潮部分，倪永仁试图通过逼迫警察开枪来杀死自己，以此来保护自己的家人。