杀死屋顶上的树根可以尝试以下方法：

1. 化学药剂：使用除根剂（如Glyphosate）对树根进行处理。这种化学药剂能够杀死植物，包括树根。请在购买和使用化学药剂时务必遵循生产商的说明，并确保采取必要的安全措施。

2. 切割树干：找到树干的位置，并使用锯子将其砍掉。这将削弱树根的养分供应，导致它们逐渐枯死。

3. 加热处理：使用热蒸汽或热空气来处理树根。高温会破坏树根的细胞结构，使其死亡。这种方法可能需要专业的设备和技能。

4. 挖掘树根：使用铲子和锄头将树根周围的土壤挖开，暴露树根。然后，用铲子将树根切断。这种方法可能需要较长时间和体力劳动。

5. 生物控制：可以尝试引入天敌或病原体来杀死树根。例如，某些昆虫或真菌可以侵入树根，导致其死亡。这种方法可能需要较长时间才能看到效果。

请注意，在采取任何行动之前，请确保您拥有合适的许可证和遵循当地法规。在处理树根时，请确保采取适当的安全措施，以防止意外伤害。