是的，拼多多取消活动会扣保证金。

因为拼多多的活动需要提前预定场地、准备物资、邀请人员等等，一旦取消活动，这些成本都无法收回。

为保证商家诚信，拼多多会规定一定的保证金，并在活动取消时扣除部分保证金作为赔偿。

需要注意的是，不同的活动规定的保证金数额不同，还受到商家的信用等级、参与次数等多种因素的影响。

在决定参与拼多多活动时，商家需要充分了解活动规定以及相应的保证金情况，做出决策。