农村自建房桩基础施工需按照以下步骤进行：

首先，确定桩位并测量放线，确保桩位准确无误；

接着，根据地质勘察报告选择合适的桩型，如预制桩或灌注桩；

然后，进行桩身施工，注意控制垂直度和深度；施工完成后，进行桩身质量检测和验收，确保符合设计要求。整个过程中，需严格遵守施工规范和安全操作规程，确保施工质量和安全。