巨贸JMC5C和JMC5A的区别在于安全功能不同。

JMC5C内置了安全算法，可以实现安全传输，而JMC5A没有内置此功能，需要外部安全设备才能实现安全传输。此外，JMC5A还支持外部存储设备，而JMC5C不支持。