如果三岁儿童的户口不在广州，需要按照以下步骤办理护照：

前往广州市公安局出入境管理处或各区、县级市公安机关出入境管理部门进行咨询，了解办理护照的具体流程和要求。

根据要求准备相关材料，包括儿童本人身份证、出生证明、监护人身份证、护照照片等。

提交申请，并缴纳护照费用。

等待审批，并按照要求进行面试或指纹采集等手续。

如果审批通过，将获得回执，凭此回执在指定日期领取护照。

需要注意的是，不同地区的护照办理流程和要求可能会有所不同，建议提前了解当地的具体规定，以免出现不必要的麻烦。同时，儿童办理护照需要监护人陪同，并确保提供的材料真实、有效。