西非侧颈龟的过滤器种类有多种，一般根据激流过滤器、内置过滤器和外置过滤器分为三种。其中，激流过滤器是一种喷头射出水流造成的回旋流，通过过滤介质（如海绵等）过滤掉污染物，是一种常见的过滤器类型。

内置过滤器是将过滤器放置在龟缸内部，利用水泵循环水体使水经过过滤器过滤，该过滤器较常见于小型龟缸使用。

外置过滤器则是将过滤器放在龟缸外部，利用水泵将污水抽出，通过过滤器过滤再回到水槽里，该过滤器适合大型龟缸或多育龟鱼同时使用。根据龟缸大小、使用需求等选择不同种类的过滤器可达到更好的效果。