1 在于它们所含的微生物种类和作用机理不同。

2 EM菌主要包括乳酸菌、酵母菌和光合细菌等，可以促进水质的生物降解和有机质的分解，同时也可以提高水中的溶氧量和pH值，从而改善水质环境。

益生菌则是一种以益生菌为主要成分的微生物制剂，主要通过调节肠道菌群平衡、促进营养物质的吸收和消化等方式来提高鱼的健康水平。

3 如果想要在养殖过程中达到不同的目的，可以选择使用不同种类的微生物制剂，例如可以同时使用EM菌和益生菌来综合改善水质环境和提高鱼的健康水平。