主要在于含硫量的不同，也就是燃料油在燃烧后排放气体对大气的污染程度不同。

他们和原油都有着千丝万缕的联系，之所以上市低硫燃料油，主要是出于环境保护的要求，有些海域规定船用燃油硫含量不超过0.50%m/m的规定。意味着低硫燃料油会逐渐取代高硫燃料油。

从低硫燃料油生产工艺来看，低硫原料油和高硫燃料油按照一定比例可以混合，调制可以生产出低硫燃料油，或者对高硫燃料油进行脱硫也能生产出低硫燃料油。