禁止杭州与上海的航运原因与他创办轮船招商局有关。

轮船招商局是中国近代第一家现代化的航运企业，也是第一家公司制企业，由李鸿章等人于1872年11月在上海创立。

李鸿章想要利用轮船招商局来发展中国的海军和商业，抵抗外国的侵略和竞争。他为了保护轮船招商局的利益，而限制了其他地方的水运。