4s店购车办理营运证的流程一般分为以下几步：

首先需要持有购车的身份证、驾驶证、行驶证等一系列相关证件进行到当地车管所进行体检，完成体检后，根据车型和用途书进行税费缴纳，然后进行提交申请，车管所会审查申请材料并审批。

审核通过后，持有人需要在车管所拿取临时营运证，然后在规定时间内到当地公安机关申办正式营运证，拿到正式营运证后即可合法营运。该过程时间较长，需要耐心等待和协调。